Мелководье пещера (Японский: あさせ の ほらあな Мелководье пещера) находится в месте в Hoenn. Он находится к северу от города Mossdeep, на шоссе № 125, и является единственным местом в покемонов рубин, сапфир, изумруд и где дикие Spheal и Snorunt можно столкнуться. Мелководье Пещера имеет несколько уровней местности, можно попасть только в определенное время дня, в связи с приливами и отливами. Во время отлива, игрок может получить доступ к области, которые затоплены в приливе. Во время прилива, игрок может получить доступ к области вне досягаемости в отливе использованием Surf. Общая площадь доступной во время прилива меньше, чем во время отлива.